首先，是要给它们安一个“家”。许多细菌只有在依附于某些物体时才能正常生长，在漂浮状态下则生长迟缓甚至停滞。这个“家”就是我们常说的滤材，其种类繁多，曹立的相关文章都有描述。它们的共同特点就是体积小而表面积极大，这样就可以在容积有限的水族箱里为硝化细菌提供大量的依附表面。对于需氧菌，这个 “家”还必须保证每一个角落都有充足水流，以满足它们对氧气的需求。对于厌氧菌则刚好相反，需要“微流”的环境，保证氧的低供给，以利于脱氮反应的进行（详见smilecathy的翻译文章）。其次，是要添加细菌生长所需的养料。我个人习惯是在新缸里投放一点水蚤，黑暗中这些小家伙会散布到水族箱各个角落，他们死亡后的尸体就成了细菌的“饲料”。1周后可以放养孔雀、红剑之类的鱼，数量不可太多，3-4条足够，他们的代谢产物、残饵都是细菌的好营养，另外也可以放些蜗牛，用以除去刚刚兴起的藻类（种草前最好将蜗牛请出去，否则可能会把水草啃得千疮百孔，不过千万别用除蜗牛剂），这样一般2-3周就可以放鱼了。至于海水缸，有文献报道说加入切碎的蛤肉有助于生物过滤的成熟（得忍受它们腐烂时的臭味了，但臭味不正说明有细菌在大量生长吗？）。现在超市里有卖一种叫“乳果糖”（这是学名，商品名就有很多了）的东西，理论上讲也是细菌尤其是厌氧菌的“补品”，新缸里添加一点应该有好处，不过我没试过，有兴趣的朋友不妨试试（后果自负喔，不过反正是新缸什么都没养，大不了全缸换水）。

　　至于生物过滤系统建立以后的步骤，倒是可以DIY一点，根据需要加入系统的其他元素（自然界中这些元素是“一个都不能少”的，但在人为控制下并不是缺一不可，详见下一节），然后自己慢慢调整，例如：裸缸养鱼的可以先放琵琶之类体格强健的食藻鱼，控制好藻类后放入自己中意的鱼；做水草造景的则可以放入黑壳虾、小精灵等等，并逐渐将灯光调至最佳，然后种草造景，最后放鱼作为点缀……但有一点非常重要，就是不管哪种缸，放鱼都要从易到难逐渐增加，不要一下子把缸塞满，否则刚刚建立的过滤系统有可能不堪重负而崩溃，那你就得从新来过了。这里顺便提一下种草，前面说过水草也有净水功能，它们不会给过滤系统带来很大负担，所以目前水族界的意见是一下子把缸全种满（当然指做水草造景缸），这样可以避免藻类“翻身”。不过，一些好看难养的草在这种还不十分稳定的环境里不容易长好，甚至会发生腐烂。我的意见是红蝴蝶之类的草慢慢来，先用水兰等铺满缸，作好早期的区域分割规划，等稳定后再逐步用好草替换出那些“丑小鸭”。